마쓰모토 시(일본어: 松本市, まつもとし, 문화어: 마쯔모또 시)는 나가노 현에서 나가노 시 다음으로 큰 도시이다. 특례시으로 지정되어 있다. 나가노 현의 가장 큰 대학인 신슈 대학이 있는 곳이기도 하다.
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